Adhesi GPCR adalah sekelompok sensor permukaan sel yang terkait dengan banyak fungsi dan penyakit tubuh. Namun, mereka belum cukup diselidiki untuk menggunakannya untuk terapi. Pusat Penelitian Kolaboratif 1423 di Universitas Leipzig bertujuan untuk mengubahnya. Para ilmuwan dari Fakultas Kedokteran kini telah mengembangkan sistem penomoran inovatif untuk domain gain, domain protein yang umum untuk semua GPCR adhesi. Ini harus membantu untuk mengklasifikasikan peran domain protein ini dengan lebih baik dalam penyakit dan membuka jalan bagi pendekatan eksperimental yang lebih tepat. Karya ini diterbitkan dalam jurnal Nature Communications.
Adhesi G reseptor protein-coupled membentuk kelas besar protein membran yang mengenali rangsangan kimia dan mekanik dalam tubuh. Domain gain memainkan peran sentral dalam aktivasi GPCR adhesi. Sampai sekarang, penelitian telah dibatasi oleh rendahnya kesamaan dari urutan asam amino dari domain gain yang berbeda, yang telah menghambat transfer pengetahuan dan analisis komparatif. Sistem penomoran baru yang dikembangkan oleh para peneliti di Universitas Leipzig sekarang menciptakan dasar yang seragam untuk transfer hasil penelitian yang tepat antara berbagai sistem model dan manusia. Ini didasarkan pada analisis struktural lebih dari 14.000 struktur yang dimodelkan dari domain gain, yang dihasilkan menggunakan metode AI terbaru.
Peter Hildebrand, Profesor Membran dan Biofisika Sel di Universitas Leipzig, yang memimpin penelitian dengan partisipasi internasional, mengatakan: “Sistem penomoran baru kami adalah langkah penting dalam penelitian GPCR. Ini memfasilitasi penelitian dasar dan mempromosikan studi komparatif. Ini menyediakan a Dasar yang solid untuk penelitian biologi biokimia, bioinformatika dan struktural lebih lanjut. ” Sistem yang baru dikembangkan memungkinkan, misalnya, untuk lebih memahami mutasi yang relevan dengan penyakit dalam domain gain, yang memberikan wawasan yang lebih dalam tentang peran mereka dalam penyakit seperti kanker.
Analisis dapat digunakan untuk penyakit ginjal
Dalam publikasi saat ini, para ilmuwan menemukan bahwa sistem penomoran mereka juga memungkinkan analisis dan perbandingan domain gain protein penyakit ginjal polikistik. Penyakit genetik ini mengarah pada pembentukan kista yang diisi cairan di ginjal dan organ lainnya.
Florian Seufert, penulis pertama publikasi saat ini dan mahasiswa doktoral di Institut Fisika Medis dan Biofisika, mengatakan: “Pekerjaan interdisipliner di SFB1423 dan kontak kami di Berlin dan Kopenhagen membawa berbagai perspektif ke sebuah proyek seperti ini. Ini telah. memungkinkan kami untuk mengembangkan sistem kami dengan cara yang ramah pengguna, membuka pintu ke banyak peluang penelitian baru.
Sistem penomoran baru telah diintegrasikan ke dalam basis data yang banyak digunakan secara internasional pada GPCR, memfasilitasi akses global dan pertukaran pengetahuan bagi para peneliti.
Publikasi Asli di Nature Communications: Penomoran Residu Generik dari Domain Gain GPCR Adhesion. Doi: https://doi.org/10.1038/s41467-024-55466-6
Publikasi saat ini diproduksi Sebagai bagian dari Pusat Penelitian Kolaboratif 1423 “Dinamika Struktural Aktivasi GPCR dan Transduksi Sinyal”, yang didanai oleh Jerman Research Foundation (DFG). Peter Hildebrand saat ini juga terlibat dalam publikasi tentang penelitian GPCR dalam jurnal Ulasan Alam Penemuan Obat .
