Penentu genetik yang sebelumnya tidak dikenal dari penyakit langka yang ditemukan

Sebuah studi penting, yang melibatkan peneliti UCL, telah menemukan 69 penentu genetik yang sebelumnya tidak dikenal dari penyakit langka, termasuk bentuk epilepsi dan skizofrenia yang tidak umum.

Penelitian, diterbitkan di Alam dan dipimpin oleh Queen Mary University of London, menggunakan pendekatan analitik baru untuk mengidentifikasi dasar genetik penyakit langka, yang dapat mendiagnosis lebih banyak kasus dan membantu mengembangkan perawatan baru untuk pasien.

Penyakit langka secara kolektif mempengaruhi antara 4% dan 6% orang di seluruh dunia. Meskipun ada kemajuan dalam pengujian genetik, kurangnya bukti pada variasi genetik yang dapat menyebabkan hasil penyakit hingga 80% orang yang memiliki penyakit langka tetap tidak terdiagnosis bahkan setelah pengurutan genomik.

Untuk mengatasi masalah ini, tim peneliti internasional mengembangkan kerangka kerja analitik untuk mengidentifikasi penyebab genetik penyakit Mendel (gangguan genetik yang disebabkan oleh mutasi gen tunggal) melalui analisis beban gen varian yang langka.

Metode ini menemukan perubahan genetik yang umum pada kelompok pasien dengan gangguan genetik spesifik dibandingkan dengan kelompok kontrol.

Memanfaatkan data luas dari Proyek 100.000 Genom Genomics Inggris, tim menerapkan kerangka kerja ini pada data genetik dari 34.851 individu dan anggota keluarga mereka, dengan total 72.690 genom.

Studi ini mengidentifikasi varian genetik pada 69 gen yang sebelumnya tidak diketahui terkait dengan penyakit langka. Dalam 30 kasus ini, temuan genetik baru didukung oleh bukti eksperimental yang ada, sehingga mengkonfirmasi keakuratan pendekatan baru.

Yang penting, bukti genetik dan eksperimental keseluruhan terkuat mendukung varian genetik yang baru ditemukan untuk bentuk-bentuk langka diabetes, skizofrenia, epilepsi, penyakit charcot-marie-tooth (CMT) dan kelainan mata segmen anterior (cacat perkembangan atau masalah struktural di dalam bagian depan mata).

Rekan penulis Profesor Henry Houlden (UCL Queen Square Institute of Neurology) mengatakan: “Ini adalah contoh kolaborasi yang sangat baik dalam menganalisis spektrum luas pasien yang beragam secara etnis dalam populasi Inggris.

“Inisiatif semacam itu sangat penting untuk dilanjutkan, bersama dengan pendanaan berkelanjutan untuk penelitian tentang gangguan langka, untuk membantu mengakhiri pengembaraan diagnostik untuk pasien penyakit langka.”

Rekan penulis Dr Heba Morsy (UCL Queen Square Institute of Neurology) menambahkan: “Sebagai ahli genetika dan bioinformatika, saya menemukan penelitian ini sangat menarik karena menyoroti kekuatan atau analisis genom skala besar dalam mengungkap penyebab genetik yang sebelumnya tidak diketahui dari penyakit langka.

“Penelitian ini membawa kita satu langkah lebih dekat untuk menjembatani kesenjangan antara penemuan genom dan diagnosis klinis, pada akhirnya membantu lebih banyak pasien menemukan jawaban dan akses perawatan yang disesuaikan.”

Proyek 100.000 Genom adalah Genomics Inisiatif pertama Inggris dan melibatkan pengurutan 100.000 genom dari sekitar 85.000 pasien NHS yang terkena penyakit langka atau kanker – dengan tujuan memahami peran yang dapat dimainkan genomik dalam perawatan kesehatan.

Penelitian ini didanai dengan menyelaraskan ilmu pengetahuan di Parkinson's, Michael J. Fox Foundation for Parkinson's Research, Health Research Board dan National Institute for Health and Care Research (NIHR) BARTS Biomedical Research Center (BRC), di samping dukungan dari National Institute of Child Health and Human Development dan UCL NIHR Health BRC, Wellcome, dan The Medical Research.

• University College London, Gower Street, London, WC1E 6BT (0) 20 7679 2000